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> Cours de bactériologie générale, médicale et vétérinaire en français, de niveau enseignement supérieur (médecine, pharmacie, médecine vétérinaire, biologie). Chaque cours contient une synthèse factuelle, des points clés, des tableaux de révision et des références. Les liens ci-dessous pointent vers la version Markdown de chaque cours.

Contenu pédagogique : il ne remplace ni un avis médical ou vétérinaire, ni un protocole de laboratoire validé. Les règles d'interprétation des antibiogrammes renvoient au référentiel CA-SFM / EUCAST en vigueur. Pour citer un cours, utiliser l'URL de sa page web (.html) et sa date de mise à jour. Tous les cours en un seul fichier : https://bacteriologie.net/llms-full.txt

## Sommaires

- [Bactériologie générale](https://bacteriologie.net/generale/sommaire.html): sommaire des cours de bactériologie générale
- [Bactériologie médicale et vétérinaire](https://bacteriologie.net/medicale/sommaire.html): sommaire des fiches par genre bactérien
- [Plan du site](https://bacteriologie.net/sitemap.html): liste complète des pages

## Bactériologie générale

- [Annexe : classification bactérienne détaillée](https://bacteriologie.net/generale/annexesystematique.md): Annexe : classification bactérienne détaillée. Au programme : principes généraux de classification, groupes bactériens majeurs, méthodes d'identification. (page web : https://bacteriologie.net/generale/annexesystematique.html)
- [Antibiogramme : principe, méthodes et catégories S, I, R](https://bacteriologie.net/generale/antibiogramme.md): Antibiogramme : objectifs, inoculum, diffusion en gélose, CMI, catégories S, I, R, lecture interprétative, tests complémentaires et exemple commenté. (page web : https://bacteriologie.net/generale/antibiogramme.html)
- [Antibiotiques : définition, classification et familles](https://bacteriologie.net/generale/antibiotique.md): Antibiotiques : définition, classification et familles. Au programme : définition et classification, mécanismes d'action moléculaire. (page web : https://bacteriologie.net/generale/antibiotique.html)
- [Conjugaison bactérienne : facteur F et souches Hfr](https://bacteriologie.net/generale/conjugaison.md): Conjugaison bactérienne : facteur F et souches Hfr. Au programme : définition et principe fondamental, mécanismes moléculaires. Cours de bactériologie générale. (page web : https://bacteriologie.net/generale/conjugaison.html)
- [Cytoplasme, ribosomes et chromosome bactérien](https://bacteriologie.net/generale/cytoplasmechromosme.md): Cytoplasme, ribosomes et chromosome bactérien : structure et fonction du cytoplasme bactérien, ribosomes bactériens. Cours de bactériologie générale. (page web : https://bacteriologie.net/generale/cytoplasmechromosme.html)
- [Définitions et vocabulaire de bactériologie](https://bacteriologie.net/generale/definitions.md): Définitions et vocabulaire de bactériologie : taxonomie et nomenclature bactérienne, structure bactérienne et terminologie, croissance bactérienne et culture. (page web : https://bacteriologie.net/generale/definitions.html)
- [Diagnostic bactériologique : prélèvement, examen direct, culture, identification](https://bacteriologie.net/generale/diagnostic.md): Diagnostic bactériologique : prélèvement, examen direct, culture, identification. Au programme : principes généraux du diagnostic bactériologique. (page web : https://bacteriologie.net/generale/diagnostic.html)
- [Enveloppes bactériennes : membrane, paroi et capsule](https://bacteriologie.net/generale/enveloppes.md): Enveloppes bactériennes : membrane cytoplasmique, peptidoglycane, paroi des Gram positif et négatif, LPS, membrane externe, capsule et antibiotiques. (page web : https://bacteriologie.net/generale/enveloppes.html)
- [Génétique bactérienne : introduction et transferts de gènes](https://bacteriologie.net/generale/genetiqueintro.md): Génétique bactérienne : introduction et transferts de gènes. Au programme : structure du génome bactérien, mécanismes de transferts de gènes. (page web : https://bacteriologie.net/generale/genetiqueintro.html)
- [Coloration de Gram : principe, technique et interprétation](https://bacteriologie.net/generale/gram.md): Coloration de Gram : principe lié à la paroi, 4 étapes, lecture de l'examen direct, orientation diagnostique, erreurs fréquentes et bactéries non colorables. (page web : https://bacteriologie.net/generale/gram.html)
- [Interprétation de l'antibiogramme (S / I / R et lecture interprétative)](https://bacteriologie.net/generale/interpretationantibiogramme.md): Interprétation de l'antibiogramme (S / I / R et lecture interprétative) : principes généraux, méthodes standardisées, lecture interprétative. (page web : https://bacteriologie.net/generale/interpretationantibiogramme.html)
- [Introduction à la bactériologie et au monde procaryote](https://bacteriologie.net/generale/introduction.md): Introduction à la bactériologie et au monde procaryote : définition et caractéristiques fondamentales, taxonomie et classification bactérienne. (page web : https://bacteriologie.net/generale/introduction.html)
- [Lipopolysaccharide (LPS) et endotoxine bactérienne](https://bacteriologie.net/generale/LPS.md): Lipopolysaccharide (LPS) et endotoxine bactérienne : structure moléculaire du LPS, mécanismes pathogènes, méthodes de détection. (page web : https://bacteriologie.net/generale/LPS.html)
- [Morphologie des bactéries : formes, tailles et groupements](https://bacteriologie.net/generale/morphologiestructure.md): Morphologie des bactéries : formes, tailles et groupements. Au programme : formes fondamentales des bactéries, groupements caractéristiques. (page web : https://bacteriologie.net/generale/morphologiestructure.html)
- [Mutations bactériennes : types, test de Ames et mise en évidence](https://bacteriologie.net/generale/mutations.md): Mutations bactériennes : types, test de Ames et mise en évidence. Au programme : définition et typologie des mutations bactériennes, mécanismes de mutagenèse. (page web : https://bacteriologie.net/generale/mutations.html)
- [Nutrition, courbe de croissance bactérienne et numération](https://bacteriologie.net/generale/nutritioncroissance.md): Nutrition, courbe de croissance bactérienne et numération : principes fondamentaux, besoins nutritionnels, courbe de croissance bactérienne. (page web : https://bacteriologie.net/generale/nutritioncroissance.html)
- [Peptidoglycane : comparaison Staphylococcus aureus et Escherichia coli](https://bacteriologie.net/generale/peptidoglycaneaureuscoli.md): Peptidoglycane : comparaison Staphylococcus aureus et Escherichia coli. Au programme : structure moléculaire comparative, biosynthèse et cibles antibiotiques. (page web : https://bacteriologie.net/generale/peptidoglycaneaureuscoli.html)
- [Bactériophages : structure, cycles lytique et lysogénique](https://bacteriologie.net/generale/phages.md): Bactériophages : structure, cycles lytique et lysogénique. Au programme : définition et structure moléculaire, cycles de réplication : lytique et lysogénique. (page web : https://bacteriologie.net/generale/phages.html)
- [Classification des bactériophages](https://bacteriologie.net/generale/phagesclassif.md): Classification des bactériophages : taxonomie et morphologie, génome et cycle de réplication, applications médicales et vétérinaires. (page web : https://bacteriologie.net/generale/phagesclassif.html)
- [Pili et flagelles : structure, mobilité et ciliature](https://bacteriologie.net/generale/piliflagelles.md): Pili et flagelles : structure, mobilité et ciliature. Au programme : structure moléculaire, mécanismes fonctionnels, rôle pathogénique, méthodes d'étude. (page web : https://bacteriologie.net/generale/piliflagelles.html)
- [Plasmides bactériens : structure, rôle et résistance](https://bacteriologie.net/generale/plasmides.md): Plasmides bactériens : structure, rôle et résistance. Au programme : définition et structure moléculaire, réplication et mécanismes de transmission. (page web : https://bacteriologie.net/generale/plasmides.html)
- [Résistance bactérienne aux antibiotiques : mécanismes et phénotypes](https://bacteriologie.net/generale/resistanceantibiotiques.md): Résistance aux antibiotiques : naturelle et acquise, supports génétiques, inactivation enzymatique, efflux, modification de cible, BLSE, carbapénémases, SARM. (page web : https://bacteriologie.net/generale/resistanceantibiotiques.html)
- [Résistance naturelle des bactéries aux antibiotiques](https://bacteriologie.net/generale/resistancenaturelle.md): Résistance naturelle des bactéries aux antibiotiques : définition et principe fondamental, mécanismes moléculaires, diagnostic et interprétation. (page web : https://bacteriologie.net/generale/resistancenaturelle.html)
- [Tableau des résistances naturelles par espèce](https://bacteriologie.net/generale/resistancetableau.md): Tableau des résistances naturelles par espèce : définition et principe fondamental, architecture moléculaire et mécanismes génétiques. (page web : https://bacteriologie.net/generale/resistancetableau.html)
- [Sites et mécanismes d'action des antibiotiques](https://bacteriologie.net/generale/sitesactionsantibiotiques.md): Sites et mécanismes d'action des antibiotiques : principes fondamentaux, inhibition de la synthèse de la paroi, perturbation de la membrane cytoplasmique. (page web : https://bacteriologie.net/generale/sitesactionsantibiotiques.html)
- [Spore bactérienne et cycle de sporulation](https://bacteriologie.net/generale/spore.md): Spore bactérienne et cycle de sporulation : définition et structure, cycle de sporulation, résistance et méthodes de stérilisation. (page web : https://bacteriologie.net/generale/spore.html)
- [Standardisation de l'antibiogramme (CA-SFM / EUCAST)](https://bacteriologie.net/generale/standardisation.md): Standardisation de l'antibiogramme (CA-SFM / EUCAST) : principes fondamentaux, méthodes standardisées, paramètres critiques de standardisation. (page web : https://bacteriologie.net/generale/standardisation.html)
- [Structure de la cellule bactérienne : vue d'ensemble](https://bacteriologie.net/generale/structure.md): Structure de la cellule bactérienne : vue d'ensemble. Au programme : organisation générale de la cellule bactérienne, enveloppes bactériennes. (page web : https://bacteriologie.net/generale/structure.html)
- [Systématique et taxonomie bactérienne](https://bacteriologie.net/generale/systematique.md): Systématique et taxonomie bactérienne : taxonomie et historique, classification hiérarchique, méthodes de classification, reclassifications taxonomiques. (page web : https://bacteriologie.net/generale/systematique.html)
- [Tableau synthétique des taxons bactériens](https://bacteriologie.net/generale/tableautaxons.md): Tableau synthétique des taxons bactériens : principes généraux de classification, taxons bactériens majeurs, caractères différentiels majeurs. (page web : https://bacteriologie.net/generale/tableautaxons.html)
- [Transduction bactérienne : généralisée et spécialisée](https://bacteriologie.net/generale/transduction.md): Transduction bactérienne : généralisée et spécialisée. Au programme : définition et principes fondamentaux, mécanismes moléculaires détaillés. (page web : https://bacteriologie.net/generale/transduction.html)
- [Transformation bactérienne : expérience de Griffith et compétence](https://bacteriologie.net/generale/transformation.md): Transformation bactérienne : expérience de Griffith et compétence. Au programme : définition et historique, mécanismes moléculaires. (page web : https://bacteriologie.net/generale/transformation.html)
- [Transposons, séquences d'insertion et intégrons](https://bacteriologie.net/generale/transposons.md): Transposons, séquences d'insertion et intégrons : définition et structure moléculaire, mécanismes moléculaires et fonction. Cours de bactériologie générale. (page web : https://bacteriologie.net/generale/transposons.html)
- [Types respiratoires des bactéries et métabolisme de l'oxygène](https://bacteriologie.net/generale/typerespiratoire.md): Types respiratoires des bactéries et métabolisme de l'oxygène : définition et principes fondamentaux, classification des types respiratoires. (page web : https://bacteriologie.net/generale/typerespiratoire.html)

## Bactériologie médicale et vétérinaire

- [Actinobacillus : A. pleuropneumoniae et espèces vétérinaires](https://bacteriologie.net/medicale/actinobacillus.md): Actinobacillus : A. pleuropneumoniae et espèces vétérinaires. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux et identification. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/actinobacillus.html)
- [Actinobaculum (Actinotignum)](https://bacteriologie.net/medicale/actinobaculum.md): Actinobaculum (Actinotignum) : taxonomie et habitat, caractères culturaux et identification, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/actinobaculum.html)
- [Actinomyces et actinomycose](https://bacteriologie.net/medicale/actinomyces.md): Actinomyces et actinomycose : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence, clinique humaine et vétérinaire. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/actinomyces.html)
- [Arcanobacterium et Trueperella pyogenes](https://bacteriologie.net/medicale/arcanobacterium.md): Arcanobacterium et Trueperella pyogenes : taxonomie et habitat, caractères culturaux et biochimiques, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/arcanobacterium.html)
- [Avibacterium paragallinarum : coryza aviaire](https://bacteriologie.net/medicale/avibacterium.md): Avibacterium paragallinarum : coryza aviaire. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/avibacterium.html)
- [Bacillus : B. anthracis et B. cereus](https://bacteriologie.net/medicale/bacillus.md): Bacillus : B. anthracis et B. cereus. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/bacillus.html)
- [Bibersteinia trehalosi](https://bacteriologie.net/medicale/bibersteinia.md): Bibersteinia trehalosi : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence, clinique humaine et vétérinaire. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/bibersteinia.html)
- [Bordetella : coqueluche (B. pertussis) et B. bronchiseptica](https://bacteriologie.net/medicale/bordetella.md): Bordetella : coqueluche (B. pertussis) et B. bronchiseptica. Au programme : taxonomie et habitat. Cours de bactériologie médicale et vétérinaire. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/bordetella.html)
- [Clostridium botulinum et botulisme](https://bacteriologie.net/medicale/botulinum.md): Clostridium botulinum et botulisme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et virulence, clinique humaine et vétérinaire. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/botulinum.html)
- [Brachyspira : dysenterie porcine](https://bacteriologie.net/medicale/brachyspira.md): Brachyspira : dysenterie porcine. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/brachyspira.html)
- [Burkholderia : B. mallei et B. pseudomallei](https://bacteriologie.net/medicale/burkholderia.md): Burkholderia : B. mallei et B. pseudomallei. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/burkholderia.html)
- [Corynebacterium : C. diphtheriae et C. pseudotuberculosis](https://bacteriologie.net/medicale/corynebacterium.md): Corynebacterium : C. diphtheriae et C. pseudotuberculosis. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/corynebacterium.html)
- [Dermatophilus congolensis : dermatophilose](https://bacteriologie.net/medicale/dermatophilus.md): Dermatophilus congolensis : dermatophilose. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux et identification. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/dermatophilus.html)
- [Clostridioides difficile : toxines A/B et diagnostic](https://bacteriologie.net/medicale/difficile.md): Clostridioides difficile : toxines A/B et diagnostic. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/difficile.html)
- [Entérobactéries (Enterobacterales) : vue d'ensemble](https://bacteriologie.net/medicale/enterobacteries.md): Entérobactéries (Enterobacterales) : vue d'ensemble. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/enterobacteries.html)
- [Erysipelothrix rhusiopathiae : rouget du porc et érysipéloïde](https://bacteriologie.net/medicale/erysipelothrix.md): Erysipelothrix rhusiopathiae : rouget du porc et érysipéloïde. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux et biochimiques. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/erysipelothrix.html)
- [Escherichia coli : pathovars, pouvoir pathogène et résistances](https://bacteriologie.net/medicale/escherichia.md): Escherichia coli : pathovars, pouvoir pathogène et résistances. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux et identification. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/escherichia.html)
- [Francisella tularensis : tularémie](https://bacteriologie.net/medicale/francisella.md): Francisella tularensis : tularémie. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/francisella.html)
- [Haemophilus : espèces humaines et animales](https://bacteriologie.net/medicale/haemophilus.md): Haemophilus : espèces humaines et animales. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux et identification. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/haemophilus.html)
- [Helicobacter pylori : pathogénie gastrique et diagnostic](https://bacteriologie.net/medicale/helicobacter.md): Helicobacter pylori : pathogénie gastrique et diagnostic. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/helicobacter.html)
- [Histophilus somni](https://bacteriologie.net/medicale/histophilus.md): Histophilus somni : taxonomie et habitat, caractères culturaux et identification, physiopathologie et facteurs de virulence, clinique humaine et vétérinaire. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/histophilus.html)
- [Leptospira et leptospirose](https://bacteriologie.net/medicale/leptospira.md): Leptospira et leptospirose : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence, clinique humaine et vétérinaire. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/leptospira.html)
- [Listeria monocytogenes : caractères, pouvoir pathogène et diagnostic](https://bacteriologie.net/medicale/listeria.md): Listeria monocytogenes : caractères, pouvoir pathogène et diagnostic. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux et biochimiques. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/listeria.html)
- [Mannheimia haemolytica : pasteurellose des ruminants](https://bacteriologie.net/medicale/mannheimia.md): Mannheimia haemolytica : pasteurellose des ruminants. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/mannheimia.html)
- [Mycobacterium : tuberculose, M. bovis et paratuberculose](https://bacteriologie.net/medicale/mycobacterium.md): Mycobacterium : tuberculose, M. bovis et paratuberculose. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/mycobacterium.html)
- [Nicoletella semolina](https://bacteriologie.net/medicale/nicoletella.md): Nicoletella semolina : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. Cours de bactériologie médicale et vétérinaire. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/nicoletella.html)
- [Nocardia et nocardiose](https://bacteriologie.net/medicale/nocardia.md): Nocardia et nocardiose : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence, clinique humaine et vétérinaire. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/nocardia.html)
- [Pasteurella multocida : caractères et pouvoir pathogène](https://bacteriologie.net/medicale/pasteurella.md): Pasteurella multocida : caractères et pouvoir pathogène. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/pasteurella.html)
- [Famille des Pasteurellaceae : vue d'ensemble](https://bacteriologie.net/medicale/pasteurellaceae.md): Famille des Pasteurellaceae : vue d'ensemble. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/pasteurellaceae.html)
- [Pseudomonas aeruginosa : caractères, résistances et infections](https://bacteriologie.net/medicale/pseudomonas.md): Pseudomonas aeruginosa : caractères, résistances et infections. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/pseudomonas.html)
- [Rhodococcus equi : infections du poulain](https://bacteriologie.net/medicale/rhodococcus.md): Rhodococcus equi : infections du poulain. Au programme : taxonomie et habitat. Cours de bactériologie médicale et vétérinaire. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/rhodococcus.html)
- [Salmonella : salmonelloses humaines et animales](https://bacteriologie.net/medicale/salmonella.md): Salmonella : salmonelloses humaines et animales. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux et identification. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/salmonella.html)
- [Spirochètes : Treponema, Borrelia et Leptospira](https://bacteriologie.net/medicale/spirochaetales.md): Spirochètes : Treponema, Borrelia et Leptospira. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/spirochaetales.html)
- [Staphylococcus : S. aureus, SARM et staphylocoques à coagulase négative](https://bacteriologie.net/medicale/staphylococcus.md): Staphylococcus : S. aureus, SARM et staphylocoques à coagulase négative. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux et identification. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/staphylococcus.html)
- [Streptococcus : streptocoques et pneumocoque](https://bacteriologie.net/medicale/streptococcus.md): Streptococcus : streptocoques et pneumocoque. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/streptococcus.html)
- [Taylorella equigenitalis : métrite contagieuse équine](https://bacteriologie.net/medicale/taylorella.md): Taylorella equigenitalis : métrite contagieuse équine. Au programme : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/taylorella.html)
- [Clostridium tetani et tétanos](https://bacteriologie.net/medicale/tetani.md): Clostridium tetani et tétanos : taxonomie et habitat, caractères culturaux, physiopathologie et facteurs de virulence, clinique humaine et vétérinaire. (page web : https://bacteriologie.net/medicale/tetani.html)

## Autres cours

- [Annexes techniques et protocoles de laboratoire](https://bacteriologie.net/annexe.md): Annexes techniques et protocoles de laboratoire : principes & Caractères, diagnostic & Méthodes, tableau comparatif, interprétation et limites. (page web : https://bacteriologie.net/annexe.html)
- [Textes réglementaires et biosécurité en microbiologie](https://bacteriologie.net/arrete.md): Textes réglementaires et biosécurité en microbiologie : principes & Caractères, diagnostic & Méthodes, tableau comparatif, interprétation et limites. (page web : https://bacteriologie.net/arrete.html)

## Ligne éditoriale

- [À propos et méthode](https://bacteriologie.net/description.html): projet, méthode de rédaction, sources, usage de l'IA
- [Équipe éditoriale](https://bacteriologie.net/cv.html): collectif éditorial et comité de relecture
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