--- title: "Antibiogramme : principe, méthodes et catégories S, I, R" url: https://bacteriologie.net/generale/antibiogramme.html section: "Bactériologie générale" updated: 2026-11-09 reading_time_min: 6 author: Collectif éditorial de bacteriologie.net license: Usage pédagogique non commercial avec citation de la source (voir https://bacteriologie.net/copyright.html) --- # Antibiogramme : principe, méthodes et catégories S, I, R > Support pédagogique de bactériologie (bacteriologie.net). Ne remplace ni un avis médical ou vétérinaire, ni un protocole de laboratoire validé. > Source : https://bacteriologie.net/generale/antibiogramme.html · Mise à jour : 2026-11-09 ## Synthèse - L'antibiogramme mesure la **sensibilité d'une souche bactérienne** à une série d'antibiotiques, pour guider le traitement et surveiller les résistances. - La **CMI** (concentration minimale inhibitrice) est la plus faible concentration d'antibiotique qui empêche la croissance visible de la souche. - Méthodes principales : **diffusion en gélose** (disques), **microdilution** en milieu liquide (méthode de référence), **bandelettes à gradient**, automates. - Les résultats sont classés selon des **concentrations critiques** publiées par l'EUCAST et le CA-SFM. - Depuis 2019 : **S** = sensible à posologie standard ; **I** = sensible à forte posologie ; **R** = résistant. - La **lecture interprétative** déduit le mécanisme de résistance et corrige les résultats si nécessaire. ## ⚡ Points clés (à retenir) - CMI : plus faible concentration qui inhibe toute croissance visible (mg/L). - Inoculum standardisé : 0,5 McFarland ; gélose de Mueller-Hinton. - Diamètre d'inhibition et CMI varient en sens inverse. - S = sensible à posologie standard ; I = sensible à forte posologie ; R = résistant. - Concentrations critiques : EUCAST et CA-SFM, version en vigueur. - Lecture interprétative : phénotype, mécanisme, règles d'expert. - BLSE : synergie C3G / amoxicilline-acide clavulanique (« bouchon de champagne »). - SARM : dépisté par la céfoxitine. ## Objectifs - **Guider le traitement** d'une infection : choisir un antibiotique actif et, si possible, à spectre étroit. - **Détecter des mécanismes de résistance** importants (BLSE, carbapénémases, SARM, entérocoques résistants aux glycopeptides), qui déclenchent aussi des mesures d'hygiène. - **Surveiller l'épidémiologie** des résistances à l'échelle d'un service, d'un établissement ou d'un pays. Un antibiogramme n'est réalisé que sur une bactérie pertinente sur le plan clinique, isolée en culture pure et identifiée. L'identification conditionne les [antibiotiques](https://bacteriologie.net/generale/antibiotique.html) testés et les règles d'interprétation. ## CMI et concentrations critiques La **[CMI](https://bacteriologie.net/generale/standardisation.html)** est la plus faible concentration d'antibiotique qui inhibe toute croissance visible de la souche après incubation. Elle s'exprime en mg/L. Plus la CMI est basse, plus la souche est sensible. Les **concentrations critiques** sont des valeurs seuils de CMI, ou de diamètre d'inhibition, qui classent la souche en S, I ou R. Elles tiennent compte de la distribution des CMI des souches sauvages, des données pharmacocinétiques et pharmacodynamiques, et des résultats cliniques. En Europe, elles sont fixées par l'**EUCAST** ; en France, le **CA-SFM** les publie avec ses commentaires. Elles sont mises à jour régulièrement : seule la version en vigueur doit être utilisée. **Les trois catégories cliniques (définitions EUCAST depuis 2019)** | Catégorie | Signification | Conséquence pratique | | --- | --- | --- | | **S** Sensible | Forte probabilité de succès avec la posologie standard | L'antibiotique peut être utilisé à posologie usuelle | | **I** Sensible à forte posologie | Succès probable si l'exposition est augmentée (dose plus forte, mode d'administration adapté, ou concentration au site de l'infection) | Utilisable à condition d'adapter la posologie | | **R** Résistant | Forte probabilité d'échec thérapeutique, même à forte exposition | L'antibiotique ne doit pas être utilisé | *L'ancienne catégorie « intermédiaire » n'existe plus sous ce nom : « I » signifie désormais « sensible à forte posologie ».* ## Méthodes ### Préparer l'inoculum On prépare une suspension de colonies jeunes, ajustée à l'étalon **0,5 de McFarland** (environ 1 à 2 × 108 bactéries par mL). Un inoculum trop riche réduit les diamètres d'inhibition, un inoculum trop pauvre les augmente. ### Diffusion en gélose (méthode des disques) La suspension est étalée uniformément sur une gélose de **Mueller-Hinton**, additionnée de sang pour les bactéries exigeantes. On dépose des disques chargés d'une quantité définie d'antibiotique. Après incubation (en général 16 à 20 heures à 35 °C), on mesure le **diamètre de la zone d'inhibition** autour de chaque disque. Plus le diamètre est grand, plus la CMI est basse : la relation entre les deux est inverse. La méthode EUCAST impose des délais courts, résumés par la règle « 15-15-15 » : utiliser la suspension dans les 15 minutes, déposer les disques dans les 15 minutes après l'ensemencement, mettre en incubation dans les 15 minutes après le dépôt des disques. ### Détermination de la CMI - **Microdilution en milieu liquide** : méthode de référence ; gamme de concentrations en plaque. - **Bandelettes à gradient** (type E-test) : la CMI se lit à l'intersection de l'ellipse d'inhibition et de la bandelette. - **Automates** : identification et antibiogramme en quelques heures, sur des cartes ou plaques de microdilution. **Comparaison des principales méthodes** | Méthode | Résultat | Atouts | Limites | | --- | --- | --- | --- | | Diffusion en gélose | Diamètre (mm) | Simple, peu coûteuse, nombreux antibiotiques testables | Pas de CMI ; lecture en 16 à 20 h | | Microdilution | CMI (mg/L) | Méthode de référence, quantitative | Plus lourde à mettre en œuvre | | Bandelette à gradient | CMI (mg/L) | CMI pour un antibiotique précis | Coût par antibiotique | | Automates | CMI ou catégorie | Rapidité, traçabilité | Panel fixe ; certains mécanismes mal détectés | ## Lecture interprétative La lecture brute classe chaque antibiotique en S, I ou R. La **lecture interprétative** va plus loin : elle analyse l'ensemble des résultats pour reconnaître un **phénotype de résistance** et en déduire le mécanisme. Elle applique des **règles d'expert** publiées par l'EUCAST et le CA-SFM. Exemples : - un *Staphylococcus aureus* résistant à la céfoxitine est un SARM : il est rendu résistant à toutes les bêta-lactamines, sauf les céphalosporines actives sur le SARM ; - une résistance naturelle connue est toujours rendue « R », quel que soit le résultat mesuré (par exemple *Klebsiella pneumoniae* et l'amoxicilline). Des **tests complémentaires** confirment certains mécanismes : - **BLSE** : image de synergie entre un disque de céphalosporine de 3e génération et un disque d'amoxicilline + acide clavulanique (image « en bouchon de champagne ») ; - **carbapénémases** : tests biochimiques, immunochromatographiques ou moléculaires ; - **résistance inductible aux lincosamides** chez les staphylocoques et streptocoques : test de l'image en « D » entre érythromycine et clindamycine. ## Exemple commenté Exemple pédagogique fictif : antibiogramme d'une souche d'*[Escherichia coli](https://bacteriologie.net/medicale/escherichia.html)* isolée d'une urine, avec image de synergie positive. **Exemple fictif : Escherichia coli productrice de BLSE** | Antibiotique | Résultat | Commentaire | | --- | --- | --- | | Amoxicilline | **R** | Hydrolysée par la BLSE | | Amoxicilline + acide clavulanique | **V** | Résultat variable : l'inhibiteur restaure parfois l'activité in vitro | | Céfotaxime (C3G) | **R** | Phénotype BLSE | | Ceftazidime (C3G) | **R** | Phénotype BLSE | | Imipénème (carbapénème) | **S** | Les carbapénèmes ne sont pas hydrolysés par les BLSE | | Ciprofloxacine | **V** | Co-résistances fréquentes, à interpréter au cas par cas | | Fosfomycine | **S** | Exemple de souche sensible | ***S** sensible · **R** résistant · **V** variable selon la souche ou le mécanisme. Tableau pédagogique : seul l'antibiogramme de la souche, interprété selon le référentiel en vigueur, fait foi.* Interprétation : phénotype de bêta-lactamase à spectre étendu ([BLSE](https://bacteriologie.net/generale/resistanceantibiotiques.html)), à confirmer par le test de synergie. Le laboratoire le signale au clinicien et à l'équipe d'hygiène, car la souche est une bactérie multirésistante (BMR). ## Contrôle de qualité et limites Chaque série est validée par des **souches de référence** dont les résultats attendus sont connus : par exemple *Escherichia coli* ATCC 25922, *[Staphylococcus](https://bacteriologie.net/medicale/staphylococcus.html) aureus* ATCC 29213 ou *Pseudomonas aeruginosa* ATCC 27853. Limites à connaître : - l'antibiogramme est réalisé *in vitro* : il ne tient compte ni du site de l'infection, ni de l'état du patient, ni d'un biofilm ; - certaines CMI tombent dans une **zone d'incertitude technique** (ZIT, ou ATU en anglais) définie par l'EUCAST : le résultat doit alors être confirmé ou commenté ; - les bactéries exigeantes ou à croissance lente nécessitent des méthodes adaptées. > **⚠ Avertissement pédagogique** > > L'interprétation d'un antibiogramme relève du biologiste, et le choix d'un traitement du clinicien. Les exemples de cette page sont pédagogiques et ne reproduisent pas les concentrations critiques, qui évoluent chaque année. [En savoir plus](https://bacteriologie.net/avertissement.html). ## Références 1. Comité de l'antibiogramme de la Société française de microbiologie (CA-SFM) / EUCAST. *Recommandations*. Version en vigueur, [sfm-microbiologie.org](https://www.sfm-microbiologie.org). 2. EUCAST. *Clinical breakpoint tables* et *Disk diffusion method*. Versions en vigueur, [eucast.org](https://www.eucast.org). 3. Denis F., Cattoir V., Martin C., Ploy M.-C. (dir.). *Bactériologie médicale : techniques usuelles*. 3e éd. Issy-les-Moulineaux : Elsevier Masson ; 2016. 4. Société française de microbiologie. *REMIC : Référentiel en microbiologie médicale*. Édition en vigueur.